Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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