Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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