Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms