Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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