Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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