Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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