Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms