Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HTR4Q13639 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms