Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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