Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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