Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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UBE2V1Q13404 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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UBE2V1Q13404 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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UBE2V1Q13404 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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UBE2V1Q13404 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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UBE2V1Q13404 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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