Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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IFT88Q13099 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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