Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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