Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTPRJQ12913 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRJQ12913 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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