Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX10Q12887 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX10Q12887 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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