Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC1Q08554 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC1Q08554 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms