Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCNT1Q02742 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCNT1Q02742 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms