Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ELF3P78545 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF3P78545 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ELF3P78545 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ELF3P78545 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms