Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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