Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms