Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO3P55854 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO3P55854 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO3P55854 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms