Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RAB5CP51148 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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