Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLCSP50747 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLCSP50747 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLCSP50747 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms