Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MDH1P40925 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MDH1P40925 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms