Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms