Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDNFP39905 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GDNFP39905 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GDNFP39905 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GDNFP39905 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDNFP39905 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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