Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHI3L1P36222 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms