Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLT4P35916 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLT4P35916 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLT4P35916 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms