Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD12P35452 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms