Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GJB2P29033 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms