Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms