Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSSP25774 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms