Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HRCP23327 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HRCP23327 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HRCP23327 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HRCP23327 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HRCP23327 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HRCP23327 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HRCP23327 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HRCP23327 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms