Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPRAP18433 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRAP18433 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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