Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD46P15529 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD46P15529 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms