Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHAP12694 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCKDHAP12694 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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