Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms