Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSNP06396 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSNP06396 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSNP06396 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms