Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C6orf47O95873 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms