Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG7O95352 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG7O95352 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG7O95352 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms