Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SCN2BO60939 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCN2BO60939 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SCN2BO60939 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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