Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSVO60911 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSVO60911 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSVO60911 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms