Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCKDKO14874 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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