Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAP23O00161 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms