Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms