Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SDR42E2A6NKP2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms