Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NPIPB13A6NJU9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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NPIPB13A6NJU9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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NPIPB13A6NJU9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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