Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC78A2IDD5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms