Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23IPQ9Y6Y8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23IPQ9Y6Y8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms