Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A4Q9Y6R1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A4Q9Y6R1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC4A4Q9Y6R1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A4Q9Y6R1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms